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等他意识到自己的乖儿子有所异动时，却已经太晚了，青阳发动了政变将其反杀，并且以前任墟主之子的身份，顺理成章的接管了归墟。
然而，这一切都已经太晚了——自己的妹妹在这七年里，已经完全感染上了神蛊，但她的身体跟青阳不同，并非是祖祖辈辈都和神蛊共生，所以对朊粒的抵抗力也远弱于青阳。
尽管神蛊的攻击性和致死性已经很低，但妹妹还是因为身体难以适应而感到极度痛苦，出现了强烈排异反应，所受折磨甚至还在青阳当初之上。
整个归墟科研团队都无计可施，最终得出的结论，是春申遗迹附近的自然环境，或许对神蛊也有一定抑制作用，导致它百年以来都未能散播出去。
为了她能继续活下去，青阳只得将她送回了春申遗迹，但愿在这种神蛊已经共存了百年的自然环境下，它能变得稳定温和一点。
并且，青阳还将她改名为南宫羲和，让那对夫妇——也就是自己的亲生父母聊以慰藉。
至于他为什么不回去和父母相认？青阳自己认为没有那个必要，他对生身父母的记忆并不多，也还没有来得及建立感情，更何况他现在成为了墟主，骑虎难下，还有更重要的事必须去做，所以更没必要将两人拉拢进来。
青阳重新改组了归墟，但其实归墟内部本来也并非铁板一块，至少就可以分为金伦加的旧部派，和被青阳收买的亲信派。
金伦加的旧部虽然表面上仍旧听从青阳的差遣指挥，但实际上早有异心，为此青阳还特地肃清了几个干部，并组建了自己的贴身护卫——天启四骑士，将职责分配给他们。
而张克所熟悉的黑鸦则是典型的骑墙中立派，似乎谁能给他更多利益，就会为谁做事，哪怕旧主子被青阳杀了也无动于衷。
另外还存在一位干部，却让张克极为惊讶——那竟然是老吉，也就是BigG,彼岸花的创始人和领导者，他竟然也隶属于金伦加的旧部派，而且还是极为密切的亲信，如同左右手的存在。当年调查和改造青阳的全程行动，他都有在参与。
青阳绝不会容许这样的人继续存在，因此BigG早就预料到危险，提前逃离了归墟，从此隐藏于茫茫人海之中。
至于姆西斯哈，他虽然当即向青阳表达了忠诚，但廷达洛猎犬作为归墟之中的武装暗杀部队，实在太过重要，青阳无法完全信任，因此抽取了一部分职权给了手下的苍白骑士·收割者。可这样的行动，也让姆西斯哈开始有所防备，慢慢生了二心。
此时神蛊的研究项目已经开展7年了，科研人员们基本都有了不少改造和使用朊粒的心得，为了提供足够多的对照样本，归墟科研部门，便开始大力推进量产克隆人，并通过神蛊来改造克隆人的大脑和身体器官，如同积木一样拼接，让他们从大脑胚胎发育阶段，就开始被一步步培养和组装成超级人类。
——蓝姐和陆弘成，应该就是在这时候相遇的吧？张克心想道，正好算下时间，也确实到了2006年了。
这些年中，青阳的亲生父母南宫夫妇也过世了，恐怕是因为一直没能找到亲生儿子的原因，哪怕有羲和聊以慰藉，却终究还是没有挺过去。
听说到这一情况时，青阳忽然愣了一下，眼角抽动了片刻，他试图像正常人一样流出一滴泪水，然而却无论如何都做不到。
无论是悲伤的情绪、无奈的懊悔、还是自责的负担，都没法从早就被神蛊啃噬得到处空洞的大脑中浮现，就算他明白正常人应该在这个时候表现出悲伤和哭泣，但他就是没法依样画葫芦的照办。
忽然，他似乎领悟到了什么——
没错，人的确应该在这种时候哭泣，可我，或许早就不是人类了。
这些年来，他早就在日以继夜的折磨，以及接手归墟的过程中，看遍了世间的丑恶阴暗，再加上他的大脑和思维远胜于常人，加上这一次的事情，他终于意识到——自己早就不将其他人当作自我的同类，因为自己已经进化到了全新的高度。
就像人类哪怕知道，黑猩猩的DNA跟自己再如何高度相似，进化树上的亲缘关系再近，也不会把它们当成人类平等看待——那么，已经进化了的自己，不将人类当作同类，不也是理所应当的事吗？
原来是这样，自己之所以哭不出来，是因为抛弃了属于人类的脆弱情感，它们总是会让人陷入不理性的冲动中，令人或伤感或忧愁或愤怒，来干扰作为科学的判断。
就像是那个可笑的金伦加，他要不是因为沉浸于贪念和自满之中，又被自己佯装的乖巧听话所骗，以他作为墟主的手段和智力，又怎么会如此轻易的被自己篡夺？
好在，自己终于摆脱了人类的劣根性，站在更高境界的山峰上，俯瞰这个世界了——就像是人类会挑选合适的家畜，管理蓄养起来一样，自己既然成为了这个地球上最高级的物种，理所应当也必须承担管理规划低等物种的责任。
于是，青阳做出了一个影响深远的决定——他要继续大力支持神蛊项目的研究，做到对它的完全掌控，对机理本质的彻底理解，并且利用这种特殊的朊粒，来改造每个人的大脑和思维，最终彻底修正那不完美的精神与人性。
他甚至感到自己其实还是非常慈悲的，并没有想将人类完全当成蝼蚁踩死，而是作为先驱者，帮助他们进化和少走弯路。因此，青阳的心中非但没有任何负罪感，反而还充满了神圣的责任感。
当然，并不是他自己一个人嘴皮子上下动动，就能够得到实验结果的，为此，他找到了斯坦森博士，他是归墟现在的首席科学家，也是归墟组织科研部门的负责人，代号为Doctor Apocalypse,天启博士。
他是绝世罕见的天才科学家，即便是被不断改造过的青阳，都要承认他身上拥有难以估量的价值。